Pliktverkets organisation består av ett huvudkontor och tre regionkontor. Huvudkontoret, som ligger i Karlstad, består av verksledningen och tre avdelningar. Regionkontoren ligger i Stockholm, Göteborg och Kristianstad.
Schematisk bild över Pliktverkets organisation.
Huvudkontor
Verksledning
Generaldirektör och överdirektör.
Avdelningen för planering och urval
Här finns bland annat processamordnare, systemförvaltare och systemutvecklare, chefsläkare, chefspsykolog, inskrivningssamordnare och samordnare extern urval.
Avdelningen för personalredovisning och verksamhetsstöd
Här finns ekonomihandläggare, personalhandläggare, personalredovisare, jurister och säkershetsskyddschef.
Adelningen för information och teknik
Här finns bland annat informatörer/kommunikatörer, registratorer, webbmaster, drifttekniker och systemtekniker.
Regionkontor
Vid Pliktverkets regionkontor genomförs teoretiska prov samt medicinska och pykologiskka undersökningar och urval till utbildningar inom Försvarsmakten. Här arbetar bland andra läkare, sjuksköterskor, psykologer, mönstringsförrättare och handläggare. Pliktverket medverkar även vid rekrytering och urval av personal till polisen, Kriminalvården, tullen och räddningstjänsten.